协议离婚后起诉法院会怎么判

1、婚姻能否解除的问题：离婚的标准是夫妻感情确已破裂，无和好的可能，你的叙述中提到你们已经分居5年之久，已经达到感情破裂的程度，法院很可能据此判决准予离婚；
2、关于你们之间的财产问题：48万元部分你说的并不明确，在此我做个简单解答，法院首先会区分你们的财产中的夫妻共同财产和一方个人财产，然后依据双方提供的证据确定财产性质再进一步划分分配比例。
（1）结婚办酒席的钱属于你们夫妻生活的共同支出，不应由你还；
（2）投资生意和房产的部分牵扯到谁给谁的，是男方父母给你们夫妻两的还是男方个人给你父母的？谁去投资生意和房产？这几个问题需要明确；
（3）你母亲给你买的房产如果不牵扯男方出资的问题，依照现行法律规定属于你婚后受赠的个人财产，与男方无关；
3、孩子抚养权的问题。法院会本着对孩子成长有利的原则确定孩子抚养权的归属。包括双方的经济状况、家庭状况、性格是否适合抚养孩子等方面，无论哪方获得抚养权，另一方都有给付孩子抚养费的义务，直到孩子18岁。

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